智能化操作系统，作为仪器仪表自动化的重要组成部分，在实验室中发挥着越来越重要的作用。它不仅提高了工作效率，还保障了数据的准确性和安全性。但是，这种技术的应用也带来了新的挑战。

首先，智能化操作系统需要良好的硬件支持。这包括高速处理器、稳定的存储设备以及高品质的传感器等。这些硬件设施必须能够承受长时间连续运行和快速响应外部信号的情况。在选择这些硬件时，实验室工作人员需要对其性能有深入了解，以确保它们能够满足所需的自动化需求。

其次，是软件方面的问题。智能化操作系统依赖于复杂且精细微调过的软件程序，这些程序需要根据特定的实验需求进行编写和调整。如果没有专业知识，不容易实现正确功能。此外，由于软件更新迭代频繁，保持最新版本也是一个问题，因为旧版本可能无法完全兼容新型仪器或设备。

再者，是数据管理的问题。在自动化过程中产生大量数据，而如何有效地组织、存储、分析这些数据是一个巨大的挑战。不仅要考虑到物理空间上的存储要求，还要考虑到数据安全性的问题，如防止未授权访问或者网络攻击等。

此外，对于用户来说，也有一定的学习曲线。当新员工接手使用已经安装好的智能化操作系统时，他们需要花费一定时间来熟悉整个界面和流程，这对于提升工作效率是一大障碍。不过，一旦掌握了使用方法，就能极大地提高工作效率。

另外，要注意的是，当发生故障或异常情况时，即使是最先进的自动控制系统也会出现问题。在这种情况下，实验室人员必须具备快速诊断能力，并且知道如何及时采取措施以恢复正常运作。这涉及到了紧急维护计划以及对关键技术人员培训的问题。

最后，与传统手动操作相比，实施智能化操作还会引发一些伦理和社会价值观念的问题，比如是否应该让机器替代人类执行某些任务，以及这将如何影响科学研究者的角色与职责等。此类讨论虽然不直接关联到技术本身，但却关系到人与科技发展之间更深层次的情感和道德考量。

综上所述，无论是在硬件还是软件层面，都存在着诸多挑战。而解决这些问题，将有助于推动仪器仪表自动化指什么：即通过集成各种现代信息技术，使得所有相关环节都能自主完成，从而实现高效、高质量、高可靠度的人工制品生产。