水样采集与预处理
在进行水质检测之前，首先需要从河流、湖泊或地下水等自然水源中采集到代表性样的水样。通常情况下，按照国家标准的要求，我们需要收集至少三组样本，以确保数据的可靠性和代表性。在现场采集后，应立即进行冷却处理，以防止微生物活性的变化。此外，对于含有较高浓度悬浮固体或胶体的泥沙或者废物污染的土壤或沉淀物，不宜直接用作分析，而应采用适当方法去除这些干扰因素。
pH值检测
pH值是衡量溶液酸碱性的指标，它对生态系统中的许多生物具有重要影响。常见的pH计能够准确地测定0至14之间的pH值范围。对于某些特殊环境，如热泉、酸雨受影响区域等，这个参数尤为关键，因为它会直接关系到微生物群落结构和生态平衡。如果pH偏离正常范围，将会对生物体产生毒害作用，因此这项测试非常重要。
有机物（COD）及无机盐类（TDS）的检测
化学需氧量（COD）是一种用于评价有机污染物强度和总量的大型指标，它通过将样品加热并在存在氯化钙的情况下加入过量锌粉来模拟其在排放过程中的氧化反应，从而反映出该水域中可能产生臭味或色泽变差问题的一般水平。而总份离子浓度（TDS），又称为电导率，是评估土壤中矿物成分丰富程度的一个简单方法，它不仅包括了所有形式的地面元素，还包括了一些其他非金属元素如硫和磷。
重金属及农药残留
重金属如铅、汞、镉等由于其高度毒性，对人体健康构成严重威胁，因此它们在饮用水中的限量必须严格控制。而农药残留也同样是环境监控重点之一，因为长期摄入微量农药残留可能导致多种慢性疾病。为了保证饮用水安全，我们需要通过各种现代分析仪器，如原子吸收光谱仪(IAS)、四级一元共振耦合 plasma (ICP-MS) 等精密测定这些危险物质的存在情况。
微生物学考察
最后，但绝不是最不重要的一环，是对微生物群落结构进行考察。这部分工作涉及细菌、 archaea 和真核藻类等多种类型，其数量与活动状态可以反映出整个生态系统当前状况以及潜在的问题。当一个地区出现明显改变时，比如工业排放增加或者自然景观破坏，这些变化往往首先表现在微生物群落上，可以作为早期警示信号来保护更广泛的人口健康和环境整体平衡。
